质标所根据现行的双孢蘑菇生产技术规范，结合全国多地生产基地调研和质量安全风险评估研究等，总结形成了《双孢蘑菇全程质量安全控制指南》，经农业农村部农产品质量安全监管司推荐，于2020年4月29日刊登在《农民日报》上。该指南详细介绍了双孢蘑菇的栽培基质、菌种、栽培管理、出菇管理、病虫害防治等环节，为工厂化或传统模式下栽培双孢蘑菇生产提供全程质量安全控制技术指导。

2019年7月，农业农村部农产品质量安全中心批复质标所为全国食用菌全程质量控制技术中心（CAQS-GAP-KZZX005），承担全国食用菌全程质量控制技术研发、推广和培训，以及生产指导、消费引导等方面的技术创新引领工作。质标所已积极开展食用菌全程质量安全控制技术研究，为食用菌生产的质量安全提供技术保障。